消化管の細菌叢と微生物生態学

免疫機能、エネルギーバランス、さらには脳の発達と認知機能に重要な役割を果たして微生物の相互作用:人間の腸内細菌叢は、現在ダイエットで、健康と病気をホストするための重要な貢献者として認識されている。重要なことは、生理学や栄養の分野におけるこれらの進歩は、内の重要な生態学的なパラメータを初めて有効な測定を可能にし、微生物群集を研究するための方法論は、比類のない解像度とカバレッジの広さの包括的なツールキットを提供している時に来ているmicrobiome腸。過去30年間にわたり多様なツールキットは、標的微生物の定量及び半定量が、高解像度/エコシステム内で理論的にすべての微生物を識別することができる広範囲の方法のための両方の分子的方法を含め、開発されている。これらのメソッドは、あまりにも私たちは、研究者は、腸内細菌叢の生態学的機能のごく最近ブラックホールまでだったものに新たな光を当てることを可能腸内細菌叢の代謝の可能性と代謝運動の両方を測定することができます。この章では、人間の腸内細菌叢を研究するために使用される分子遺伝学的とメタボロームのアプローチのコレクションを記述します。

人間の腸は、様々なヒト疾患に大きな影響を置く多様な微生物、から構成されている。腸内細菌叢を維持胃腸ホメオスタシスおよび肥満、2型糖尿病、低悪性度の慢性炎症、および炎症性腸疾患などの代謝性疾患および炎症性疾患の間の関連付けに連結されている。結果的に、腸内微生物叢への関心の高まりは、疾患のリスクを低減し、宿主の健康を改善しているようなプロバイオティクスとプレバイオティクスなどの機能性食品の開発をもたらした。ヌクレオチド配列決定技術における最近の進歩は、以前に未知の微生物群集のプロファイルを広げる。そのようなMetaHITイニシアチブと人間Microbiomeプロジェクト(HMP)などの国際共同プロジェクトは、この新しい技術を使用してホストに腸の細菌叢の多様性とその代謝機能との相互作用を明らかにした。これらのツールの現在の進歩は、大規模なデータセットの分析を容易にし、まだ課題がmicrobiomeの完全な建設のために残っている。ここでは、新しいプロバイオティクスとプレバイオティクスを見つけるメタゲノム研究のための課題と今後の展望と一緒にメタゲノミクスの発展を議論する。